El coro bajo de este convento se abre al Presbiterio en el lado de la Epístola y frente al retablo del Sagrario. En él se debe destacar dos partes: el retablo y las pinturas murales que le adornan.
El retablo consta de un solo cuerpo, con tres calles y ático. Los cuatro estípites que dividen el espacio están coronados por cuatro angelotes. En los laterales del retablo adornos vegetales acompañan a “dos escudos de la Merced Descalza que, a modo de remates, se sitúan sobre las puertas que dan acceso a otras dependencias claustrales”.
La imagen que preside el retablo se adscribe a la tipología de María de la Merced Comendadora, “sedente en un hermoso sillón tallado en madera bajo el cual se dispone una nube (…) de querubines (…y) viste hábito de la Orden”. Destaca “su rica y vistosa policromía” que “se muestra especialmente en las ropas estofadas (y …) en el grupo de querubines”. El trono está policromado y dorado. Ha sido restaurada entre los años 2004-2005.
En el lateral derecho del retablo, escultura de María de Cervelló o Cervellón, Santa María del Socorro, mujer considerada fundadora de la Merced femenina. Es una imagen tallada en madera estofada y policromada, obra anónima de la escuela sevillana del siglo XVIII. Habitualmente se le
representa con un navío en una mano. Un segundo símbolo que le caracteriza es la palma del martirio, aunque no lo sufrió: “viste como corresponde a la Merced femenina con hábito, escapulario, capa prendida por escudo de la orden y velo negro (….)” .
En el lateral izquierdo, talla policromada de San Miguel, anónima y fechada en el primer cuarto del siglo XVIII: “la imagen viste el atuendo militar habitual en la imaginería barroca; porta coraza y escudo y blande en su diestra una espada que parece descargar sobre un imaginario enemigo”.
La construcción del coro bajo debió realizarse con ocasión de la llegada de la comunidad mercedaria en 1637. El coro se construyó en dos tramos cubiertos de falsas bóvedas de arista. En cada uno de los plementos aparece un símbolo o alegoría mariana, letanías, dentro de una cartela. En el primer tramo aparecen un espejo, un pozo, un ciprés y la estrella. En el segundo tramo el sol, una fuente, la palmera y el anagrama de María con corona real. Los dos tramos están separados por un intradós decorado a base de flores, rosas blancas, etc., sobre fondo blanco.